Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim63Q38HM4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim63Q38HM4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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