Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN7

Defb26, Beta-defensin, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb26Q30KN7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defb26Q30KN7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defb26Q30KN7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms