Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Traf3ip1Q149C2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Traf3ip1Q149C2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Traf3ip1Q149C2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3ip1Q149C2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Traf3ip1Q149C2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Traf3ip1Q149C2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Traf3ip1Q149C2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Traf3ip1Q149C2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Traf3ip1Q149C2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Traf3ip1Q149C2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Traf3ip1Q149C2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms