Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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