Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Samd12Q0VE29 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms