Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms