Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrioQ0KL02 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms