Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MestQ07646 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MestQ07646 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MestQ07646 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MestQ07646 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms