Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sh3bp2Q06649 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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