Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nf1Q04690 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms