Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax5Q02650 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms