Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GscQ02591 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GscQ02591 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms