Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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