Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms