Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms