Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited1P97769 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms