Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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