Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms