Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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