Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb13P70321 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb13P70321 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms