Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gnb1P62874 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gnb1P62874 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms