Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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