Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms