Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CgnP59242 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CgnP59242 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CgnP59242 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CgnP59242 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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