Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp25P57080 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp25P57080 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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