Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gsc2P56916 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gsc2P56916 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gsc2P56916 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gsc2P56916 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gsc2P56916 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gsc2P56916 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gsc2P56916 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gsc2P56916 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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