Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gp1bbP56400 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gp1bbP56400 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gp1bbP56400 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gp1bbP56400 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gp1bbP56400 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms