Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms