Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PctpP53808 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms