Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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