Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Tmod1P49813 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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