Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms