Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtgfrP43117 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms