Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms