Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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