Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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