Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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