Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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