Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChgaP26339 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChgaP26339 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms