Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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NdnP25233 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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