Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PparaP23204 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PparaP23204 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PparaP23204 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PparaP23204 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PparaP23204 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PparaP23204 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PparaP23204 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PparaP23204 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PparaP23204 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms