Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prim1P20664 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prim1P20664 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms