Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a2P20490 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms