Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms