Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl13aP19253 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms