Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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