Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxb1P17919 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxb1P17919 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxb1P17919 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms