Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Sptan1P16546 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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