Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RhoP15409 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RhoP15409 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhoP15409 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhoP15409 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhoP15409 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms