Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa1P11477 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms